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Text File  |  1995-03-04  |  2.4 KB  |  49 lines
  1. ************************************************************
  2. * Acyltransferases ChoActase / COT / CPT family signatures *
  3. ************************************************************
  4.  
  5. A number of eukaryotic acetyltransferases  can  be,  on  the basis of sequence
  6. similarities, grouped together into a family. These enzymes are:
  7.  
  8.  - Choline o-acetyltransferase  (EC 2.3.1.6)   (ChoAcTase), an   enzyme   that
  9.    catalyzes the biosynthesis of the neurotransmitter acetylcholine [1].
  10.  - Carnitine o-acetyltransferase (EC 2.3.1.7) [2].
  11.  - Peroxisomal carnitine octanoyltransferase (EC 2.3.1.-)  (COT), a fatty acid
  12.    beta-oxidation pathway enzyme which is involved in the transport of medium-
  13.    chain acyl-coenzyme A's from peroxisome to mitochondria [3].
  14.  - Mitochondrial carnitine palmitoyltransferases I and II (EC 2.3.1.21) (CPT),
  15.    enzymes involved in fatty acid metabolism and transport [4].
  16.  
  17. These three enzymes share many regions of sequence similarities.  As signature
  18. patterns we  selected  two of these regions.  The  first one,  located  in the
  19. N-terminal section of  these enzymes is characterized by the presence of three
  20. [LIVM]-P dipeptides. The second region, located in the central  part  of these
  21. enzymes is  characterized  by the conservation of a number of charged residues
  22. including an  histidine  which  probably plays a crucial role in the catalytic
  23. mechanism [5].
  24.  
  25. -Consensus pattern: L-P-x-[LIVMP]-P-[LIVM]-P-x-[LIVM]-x-[DENQAS]-[ST]-[LIVM]-
  26.                     x(2)-Y
  27. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  28. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  29.  
  30. -Consensus pattern: R-[FYW]-x-D-[KA]-[ST]-[LIVMFY]-x-[LIVMFY](2)-x(3)-[DNS]-
  31.                     [GS]-x(6)-[ED]-H
  32.                     [H is a probable active site residue]
  33. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  34. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  35.  
  36. -Last update: June 1994 / Text revised.
  37.  
  38. [ 1] Berrard S., Brice A., Lottspeich F., Braun A., Barde Y.-A., Mallet J.
  39.      Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 84:9280-9284(1987).
  40. [ 2] Kispal G., Tomcsanyi T., Sumegi B., Bock I., Gajdos G., Dietmayer K.,
  41.      Sandor A.
  42.      J. Biol. Chem. 268:1824-1829(1993).
  43. [ 3] Chatterjee B., Song C.S., Kim J.-M., Roy A.K.
  44.      Biochemistry 27:9000-9006(1988).
  45. [ 4] Esser V., Britton C.H., Weis B.C., Foster D.W., McGarry J.D.
  46.      J. Biol. Chem. 268:5817-5822(1993).
  47. [ 5] Schmalix W., Bandlow W.
  48.      J. Biol. Chem. 268:27428-27439(1993).
  49.